一、“重新認(rèn)定”與“復(fù)核”的概念區(qū)別
1、“重新認(rèn)定”的概念-不稱“復(fù)審”
自2016年1月1日后，《財(cái)政部國家稅務(wù)總局科學(xué)技術(shù)部關(guān)于修訂印發(fā)《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》的通知》（國科發(fā)火[2016]32號(hào)）已不使用“復(fù)審”的概念，那三年期滿再認(rèn)定，不稱“復(fù)審”，那叫什么呢？《國家稅務(wù)總局關(guān)于實(shí)施高新技術(shù)企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2017年第24號(hào)）明確，高新技術(shù)企業(yè)資格期滿再認(rèn)定，稱為“重新認(rèn)定”?！爸匦抡J(rèn)定”就是按國科發(fā)火[2016]32號(hào)和國科發(fā)火【2016】195號(hào)要求的條件重新再走一次高新技術(shù)企業(yè)的認(rèn)定流程。
2、“復(fù)核”的概念-以書面形式提請認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核
復(fù)核，是對已認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)，有關(guān)部門在日常管理過程中發(fā)現(xiàn)其不符合認(rèn)定條件的，應(yīng)以書面形式提請認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核。復(fù)核后確認(rèn)不符合認(rèn)定條件的，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)取消其高新技術(shù)企業(yè)資格，并通知稅務(wù)機(jī)關(guān)追繳其不符合認(rèn)定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠。
二、“重新認(rèn)定”與“復(fù)核”的發(fā)起人區(qū)別
1、“重新認(rèn)定”的發(fā)起人-企業(yè)主動(dòng)提出申請
“重新認(rèn)定”相當(dāng)于是一次嶄新的高企認(rèn)定，按照國科發(fā)火[2016]32號(hào)和國科發(fā)火【2016】195號(hào)的規(guī)定，由企業(yè)主動(dòng)提出申請，專家開展評(píng)審，認(rèn)定機(jī)構(gòu)審查，認(rèn)定企業(yè)由領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”公示10個(gè)工作日，無異議的，予以備案，并在“高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)”公告，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)向企業(yè)頒發(fā)統(tǒng)一印制的“高新技術(shù)企業(yè)證書”；有異議的，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)進(jìn)行核實(shí)處理。
2、“復(fù)核”的發(fā)起人-有關(guān)部門
對已認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)，有關(guān)部門在日常管理過程中發(fā)現(xiàn)其不符合認(rèn)定條件的，應(yīng)提請認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核。這里的“有關(guān)部門”，大家通常認(rèn)為是僅指稅務(wù)部門，其實(shí)還包括科技部門、環(huán)保部門、安監(jiān)部門、質(zhì)監(jiān)部門、財(cái)政部門、審計(jì)部門等有關(guān)部門。如廣東省12月13日取消了46家企業(yè)高新技術(shù)企業(yè)資格，就是國家審計(jì)署廣州特派辦提出復(fù)核的。
還有一些“復(fù)核”甚至是應(yīng)舉報(bào)人的實(shí)名舉報(bào)，推動(dòng)有關(guān)部門提請認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核。
三、“重新認(rèn)定”與“復(fù)核”的時(shí)點(diǎn)區(qū)別
1、“重新認(rèn)定”的時(shí)點(diǎn)-一般在高新技術(shù)企業(yè)資格期滿當(dāng)年
《國家稅務(wù)總局關(guān)于實(shí)施高新技術(shù)企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2017年第24號(hào)）規(guī)定，企業(yè)的高新技術(shù)企業(yè)資格期滿當(dāng)年，在通過重新認(rèn)定前，其企業(yè)所得稅暫按15%的稅率預(yù)繳，在年底前仍未取得高新技術(shù)企業(yè)資格的，應(yīng)按規(guī)定補(bǔ)繳相應(yīng)期間的稅款。為了不影響高新技術(shù)企業(yè)資格期滿當(dāng)年的優(yōu)惠享受，一般企業(yè)都是在資格期滿當(dāng)年提出重新認(rèn)定的申請。
但不排除有的企業(yè)，認(rèn)為資格期滿當(dāng)年的近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的研發(fā)費(fèi)用達(dá)不到規(guī)定的投入比例，可能在資格期滿當(dāng)年不提出重新認(rèn)定的申請，待以后年度符合條件后，再申請重新認(rèn)定。
2、“復(fù)核”的時(shí)點(diǎn)-在取得高新技術(shù)企業(yè)資格后的任何一個(gè)時(shí)點(diǎn)
對已認(rèn)定的高新技術(shù)企業(yè)，有關(guān)部門在日常管理過程中發(fā)現(xiàn)其不符合認(rèn)定條件的，應(yīng)以書面形式提請認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核。有關(guān)部門提請認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核的時(shí)點(diǎn)，有可能在高新技術(shù)企業(yè)資格有效期內(nèi)，也有可能在高新技術(shù)企業(yè)資格期期滿之后，甚至有可能在重新認(rèn)定高新技術(shù)企業(yè)資格之后。
四、“重新認(rèn)定”與“復(fù)核”研發(fā)費(fèi)占比計(jì)算，其近三個(gè)會(huì)計(jì)年度歸屬的區(qū)別
1、“重新認(rèn)定”對研發(fā)費(fèi)占比的核查年度
“重新認(rèn)定”對研發(fā)費(fèi)占比的核查年度，為重新提出高企申請之日的近三個(gè)會(huì)計(jì)年度。
2、“復(fù)核”對研發(fā)費(fèi)占比的核查年度
根據(jù)國科發(fā)火【2016】195號(hào)的規(guī)定，屬于對是否符合《認(rèn)定辦法》第十一條（除企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的研究開發(fā)費(fèi)用總額占同期銷售收入總額的比例要求外）、第十七條、第十八條和第十九條情況的企業(yè)，按《認(rèn)定辦法》規(guī)定辦理；屬于對是否符合《認(rèn)定辦法》第十一條（五）款“近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的研究開發(fā)費(fèi)用總額占同期銷售收入總額的比例”產(chǎn)生異議的，應(yīng)以問題所屬年度和前兩個(gè)會(huì)計(jì)年度（實(shí)際經(jīng)營不滿三年的按實(shí)際經(jīng)營時(shí)間計(jì)算）的研究開發(fā)費(fèi)用總額與同期銷售收入總額之比是否符合《認(rèn)定辦法》第十一條（五）款規(guī)定進(jìn)行復(fù)核。
所以，根據(jù)復(fù)核指向的問題年度，對研發(fā)費(fèi)用占比指標(biāo)之外的其他指標(biāo)，如“科技人員占比”、“高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入占比”開展“復(fù)核”，均為問題年度的當(dāng)年數(shù)據(jù)，而對研發(fā)費(fèi)占比開展核查，其近三個(gè)會(huì)計(jì)年度（均指所屬期，而非申報(bào)期）各有明確的界定：
?。?）復(fù)核指向取得高企證書的符合性，“近三個(gè)會(huì)計(jì)年度”為高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定前三個(gè)會(huì)計(jì)年度。
?。?）復(fù)核指向取得高企證書的第一年開展復(fù)核，“近三個(gè)會(huì)計(jì)年度”為高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定前兩個(gè)會(huì)計(jì)年度加上享受優(yōu)惠的第一個(gè)會(huì)計(jì)年度。
?。?）復(fù)核指向取得高企證書的第二年開展復(fù)核，“近三個(gè)會(huì)計(jì)年度”為高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定前一年個(gè)會(huì)計(jì)年度加上享受優(yōu)惠的第一個(gè)和第二個(gè)會(huì)計(jì)年度。
?。?）復(fù)核指向取得高企證書的第三年開展復(fù)核，“近三個(gè)會(huì)計(jì)年度”為享受優(yōu)惠的第一個(gè)、第二個(gè)、第三個(gè)會(huì)計(jì)年度。
五、“重新認(rèn)定”不符合與“復(fù)核”不符合的稅務(wù)處理
1、“重新認(rèn)定”不符合的稅務(wù)處理
國家稅務(wù)總局公告2017年第24號(hào)明確，高新技術(shù)企業(yè)資格期滿當(dāng)年內(nèi)，在通過重新認(rèn)定前，其企業(yè)所得稅可暫按15%的稅率預(yù)繳，在年底前仍未取得高新技術(shù)企業(yè)資格的，則應(yīng)按規(guī)定補(bǔ)繳稅款。
如，A企業(yè)的高新技術(shù)企業(yè)證書在2022年11月6日到期，在2022年季度預(yù)繳時(shí)企業(yè)仍可按高新技術(shù)企業(yè)15%稅率預(yù)繳。如果A企業(yè)在2022年年底前重新獲得高新技術(shù)企業(yè)證書，其2022年度可繼續(xù)享受稅收優(yōu)惠。如未重新獲得高新技術(shù)企業(yè)證書，則應(yīng)按25%的稅率補(bǔ)繳2022年度少繳的稅款。
2、“復(fù)核”不符合的稅務(wù)處理
國家稅務(wù)總局公告2017年第24號(hào)明確，對取得高新技術(shù)企業(yè)資格且享受稅收優(yōu)惠的高新技術(shù)企業(yè)，稅務(wù)部門如在日常管理過程中發(fā)現(xiàn)其在
高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定過程中或享受優(yōu)惠期間不符合《認(rèn)定辦法》第十一條規(guī)定的認(rèn)定條件的，應(yīng)提請認(rèn)定機(jī)構(gòu)復(fù)核。
根據(jù)國科發(fā)火【2016】195號(hào)的規(guī)定，屬于對是否符合《認(rèn)定辦法》第十一條（除企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的研究開發(fā)費(fèi)用總額占同期銷售收入總額的比例要求外）、第十七條、第十八條和第十九條情況的企業(yè)，按《認(rèn)定辦法》規(guī)定辦理；屬于對是否符合《認(rèn)定辦法》第十一條（五）款“近三個(gè)會(huì)計(jì)年度的研究開發(fā)費(fèi)用總額占同期銷售收入總額的比例”產(chǎn)生異議的，應(yīng)以問題所屬年度和前兩個(gè)會(huì)計(jì)年度（實(shí)際經(jīng)營不滿三年的按實(shí)際經(jīng)營時(shí)間計(jì)算）的研究開發(fā)費(fèi)用總額與同期銷售收入總額之比是否符合《認(rèn)定辦法》第十一條（五）款規(guī)定進(jìn)行復(fù)核。
復(fù)核后確認(rèn)不符合認(rèn)定條件的，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)取消其高新技術(shù)企業(yè)資格，并通知稅務(wù)機(jī)關(guān)追繳其證書有效期內(nèi)自不符合認(rèn)定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠。特別提醒的是，追繳期限“不符合認(rèn)定條件年度起”明確為“證書有效期內(nèi)自不符合認(rèn)定條件年度起”。
?。?）對高企資格開展復(fù)核。
企業(yè)從事研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動(dòng)的科技人員占企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)的比例、高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于60%、未發(fā)生重大安全、重大質(zhì)量事故或嚴(yán)重環(huán)境違法行為等都是審核申請認(rèn)定前一年的指標(biāo)，只有研發(fā)費(fèi)用的占比是審核三年的指標(biāo)，為最近三年、最近二年、最近一年，共三個(gè)年度的研發(fā)費(fèi)用總額與銷售收入總額占比。
如果復(fù)核不通過，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)取消其高新技術(shù)企業(yè)資格，并通知稅務(wù)機(jī)關(guān)追繳其證書有效期內(nèi)自不符合認(rèn)定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠。
?。?）對問題年度開展復(fù)核。
企業(yè)從事研發(fā)和相關(guān)技術(shù)創(chuàng)新活動(dòng)的科技人員占企業(yè)當(dāng)年職工總數(shù)的比例、高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于60%、未發(fā)生重大安全、重大質(zhì)量事故或嚴(yán)重環(huán)境違法行為等都是問題年度當(dāng)年的指標(biāo)，只有研發(fā)費(fèi)用的占比是審核三年的指標(biāo)，為問題所屬年度和前兩個(gè)會(huì)計(jì)年度（實(shí)際經(jīng)營不滿三年的按實(shí)際經(jīng)營時(shí)間計(jì)算）的研究開發(fā)費(fèi)用總額與同期銷售收入總額之比。
如果復(fù)核不通過，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)取消其高新技術(shù)企業(yè)資格，并通知稅務(wù)機(jī)關(guān)追繳其證書有效期內(nèi)自不符合認(rèn)定條件年度起已享受的稅收優(yōu)惠。
某企業(yè)2019年11月6日取得高新技術(shù)企業(yè)資格，自高新技術(shù)企業(yè)證書注明的發(fā)證時(shí)間所在年度2019年起、2019年、2020年、2021年，這三年可以申報(bào)享受15%稅收優(yōu)惠。
A.如對2019年度開展復(fù)核，復(fù)核不通過，則2019、2020、2021年度不能享受，2019、2020、2021年度已享優(yōu)惠應(yīng)追繳。
B.如對2020年度開展復(fù)核，復(fù)核不通過，則2020、2021年度不能享受，2020、2021年度已享優(yōu)惠應(yīng)追繳。
C.如對2021年度開展復(fù)核，復(fù)核不通過，則2021年度不能享受。
六、“重新認(rèn)定”不符合觸發(fā)“復(fù)核”的風(fēng)險(xiǎn)
一般來說，“重新認(rèn)定”不符合意味著近一年的研發(fā)人員占比、高新技術(shù)產(chǎn)品（服務(wù)）占比、或是近三年的研發(fā)費(fèi)用占比有一項(xiàng)或者多項(xiàng)不符合《認(rèn)定辦法》第十一條的規(guī)定，“重新認(rèn)定”不符合，根據(jù)總局公告2017年第24號(hào)的規(guī)定，在高新技術(shù)企業(yè)資格期滿當(dāng)年的年底前仍未取得高新技術(shù)企業(yè)資格的，則應(yīng)按規(guī)定補(bǔ)繳當(dāng)年季報(bào)時(shí)已按15%享受優(yōu)惠的稅款。
“重新認(rèn)定”不符合，其所對應(yīng)的核查期限與指標(biāo)與最后一年的核查期限與指標(biāo)口徑是一致的，這表明最后一年的原高企資格肯定是不符合的，這時(shí)極有可能觸發(fā)相關(guān)部門提請對原高新技術(shù)企業(yè)資格的復(fù)核，只能祈禱認(rèn)定機(jī)構(gòu)只復(fù)核最后一年的高企資格是否符合，因?yàn)樽詈笠荒陱?fù)核不通過，只不過追繳最后一年已享受的優(yōu)惠。如果復(fù)核指向到原高企資格取得時(shí)是否符合，那意味近三年已享受的優(yōu)惠均應(yīng)被追繳。
最后借用一首歌做個(gè)總結(jié)：一旦走上高企這條“高速公路”，沉默加速度，是我的腳步，奔跑在虛幻里的路，我不要復(fù)核不理會(huì)關(guān)注，奔向最遠(yuǎn)處！
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